EVENTO
Desenvolvimento de Funções Empíricas para Predição de Afinidade Proteina-Ligante.
Tipo de evento: Seminário de Avaliação - Série A
O programa de atracamento molecular receptor-ligante DockThor (GMMSB/LNCC) tem obtido resultados promissores em estudos comparativos com outros programas amplamente utilizados. Entretanto, a função de avaliação implementada atualmente não é capaz de predizer de maneira confiável as afinidades de ligação receptor-ligante observadas experimentalmente. O principal objetivo desta tese é desenvolver e validar funções de avaliação empíricas para predizer a afinidade de ligação utilizando métodos de aprendizado de máquina. As funções empíricas foram treinadas avaliando diversas combinações entre trinta e quatro termos empíricos ou energéticos (baseados no campo de força MMFF94) utilizando o conjunto de alta qualidade mais extenso descrito na literatura (PDBBind vs2013, n = 2959 complexos receptor-ligante). Uma função de avaliação geral e quatro específicas para diferentes classes de proteínas foram desenvolvidas obtendo bons desempenhos em estudos comparativos com outras funções de avaliaçã~ amplamente utilizadas pela comunidade científica internacional.
Data Início: 13/07/2015 Hora: 10:00 Data Fim: 13/07/2015 Hora: 13:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio B
Aluno: Isabella Alvim Guedes - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Orientador: Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Participante Banca Examinadora: Carlos Mauricio Rabello de Sant'Anna - UFRRJ - UFRRJ Helio José Corrêa Barbosa - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC/MCTI Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC